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核酸适配体筛选服务
泰克生物致力于为客户提供高亲和力、高特异性的核酸适配体筛选技术服务,为客户后续的适配体功能验证(包括亲和力验证、竞争ELISA验证、体外靶向细胞功能性验证(例如:核酸适配体的体外识别和抑制功能验证、体外流式阻断功能等)、体内功能验证(例如:适配体的体内靶向抑制功能验证、信号通路阻断功能验证等))及靶向特定分子药物的开发等下游研发工作提供有力支持。泰克生物在核酸适配体筛选(SELEX技术)方面拥有多年的项目经验和心得,经过多年的发展,泰克生物建立了完善的核酸适配体筛选体系,能够为客户提供高质量的针对包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸、小分子化合物等靶点的核酸适配体(包括RNA适配体和DNA适配体)筛选服务。
█ 核酸适配体开发技术服务(SELEX筛选技术服务)
核酸适配体筛选是指基于指数富集的配体系统进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)原理,将筛选靶点结合在筛选固相颗粒的表面,通过与核酸适配体文库的孵育、清洗和扩增,从核酸适配体文库中得到的目的寡核苷酸片段(DNA片段或RNA片段)。
泰克生物建立的核酸适配体文库库容为10^14数量级,足够筛选到针对各类靶点且满足客户下游实验需求的核酸适配体,候选适配体序列亲和力可达nM-pM级别。
泰克生物能提供的抗原筛选(包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸、小分子等)多种多样,适配体筛选的方法也多种多样(例如:液相SELEX、细胞SELEX等),常用的筛选方法为磁珠筛选。对于特殊的样本,筛选方式会有所不同,比如药物小分子需要筛选适配体,常常需用用到小分子改造技术。泰克生物的科学家会根据客户的项目需求进行评估,并设计最佳的方案进行抗原的修饰和适配体的筛选。核酸适配体筛选流程如图1所示:
图1核酸适配体筛选流程(SELEX方法的典型程序)
泰克生物还能提供包括但不限于核酸适配体的亲和力验证(包括BLI亲和力验证和SPR亲和力验证)、竞争ELISA验证、流式阻断验证等多种配套的下游验证实验,客户只需要提供筛选靶点和项目需求,泰克生物的科学家针对客户的项目需求提供合理的定制化的方案,解决客户的科研难题。
█ 核酸适配体开发技术服务(SELEX筛选技术服务)类型
针对常规蛋白,多肽,细胞和可修饰有机化合物小分子的核酸适配体筛选泰克生物积累了大量的项目经验,根据客户的需求我们将整理归纳总结成一下几类的核酸适配体筛选,如表1所示:
█ 核酸适配体筛选服务内容和周期
步骤 | 服务内容 | 周期 |
Step1:核酸适配体筛选 | 1) 客户提供筛选靶点信息,泰克生物进行项目评估以及修饰工作(常规修饰:biotin修饰); 2) 文库富集与筛选:6-10轮筛选,SA磁珠负筛选;NGS测序; 3) 交付:适配体序列10-50条,包含出现频次;实验报告 | 8-12周 |
Step2:适配体合成和亲和力测定 | 1) 合成生物素标记适配体(根据具体情况设计与合成); 2) 适配体与靶点快速亲和力测定(亲和力排序); 3) 交付:合成报告,亲和力测定实验报告,原始数据; | 3-4周 |
█ 核酸适配体筛选服务优势
多种筛选靶点可选:蛋白、多肽、氨 基酸、小分子 | 文库库容大,项目成功率高 | SELEX技术平台成熟:筛选获得的核酸 适配体亲和力可达nM-pM级 | 配套的下游验证实验丰富:亲和力验 证(包括BLI和SPR亲和力验证)、竞 争ELISA验证、流式阻断验证等 |
实验记录可追溯:中英文实验报告,原 始实验记录 | 一对一个性化方案定制,满足各类客 户的科研项目需求 | 6-10轮压力筛选,能够获得高亲和力、 高特异性的核酸适配体 | 多种筛选方式:磁珠-SELEX、细胞- SELEX、捕获-SELEX等 |
泰克生物致力于为客户提供高亲和力、高特异性的核酸适配体筛选技术服务,为客户后续的适配体功能验证(包括但不限于亲和力验证、竞争ELISA验证、体外靶向细胞功能性验证(例如:核酸适配体的体外识别和抑制功能验证、体外流式阻断功能等)、体内功能验证(例如:适配体的体内靶向抑制功能验证、信号通路阻断功能验证等))及靶向特定分子药物的开发等下游研发工作提供有力支持。
答:核酸适配体是一类能够与特定靶标分子(如蛋白质、小分子、病毒等)特异性结合的短链核酸分子,通常由单链DNA或RNA组成。与传统的抗体不同,核酸适配体通过在体外选择和筛选的方式获得,而非通过免疫反应产生。它们具有与抗体相似的特异性和亲和力,但相较于抗体,核酸适配体具有一些独特的优势。例如,核酸适配体可以通过化学合成快速制备,不受动物伦理问题的限制,且在较低的成本和更简便的操作下获得。此外,核酸适配体在极端条件下也能保持稳定性,如高温或极端pH条件下,而抗体则容易变性。因此,核酸适配体在生物标志物检测、药物开发、靶向治疗等方面具有广泛的应用前景。
答:核酸适配体的筛选通常采用体外筛选技术,其中最常见的方法是“系统进化的配体酶联免疫法”(SELEX)。SELEX是一种通过体外选择的方法来筛选特定靶标结合的适配体。基本步骤包括:首先合成一个含有多样性库的随机序列(通常为10^13到10^15种不同序列的核酸库);然后将该库暴露于靶标分子上,经过结合、洗涤和洗脱等步骤,保留那些能与靶标结合的序列;接着,将这些保留的适配体通过PCR扩增并进行下一轮筛选。SELEX的一个显著优点是它可以通过不断的迭代筛选来提高适配体与靶标之间的亲和力和特异性。除了传统的SELEX方法外,还有一些改进型的SELEX技术,如纳米孔SELEX、液相SELEX、微阵列SELEX等,能够提高筛选效率和特异性,满足不同应用需求。
答:在核酸适配体筛选过程中,评估适配体与靶标之间的亲和力是关键步骤。通常通过测定适配体的结合动力学来评估其亲和力,常见的技术包括表面等离子共振(SPR)、等温滴定量热法(ITC)和荧光共振能量转移(FRET)。这些技术可以提供抗原-适配体结合的详细信息,如结合速率(ka)、解离速率(kd)和解离常数(Kd)。其中,SPR技术被广泛应用于亲和力测定,因为它能够实时监测适配体与靶标的相互作用,无需标记反应物,且可以在不同条件下进行高通量筛选。此外,通过结合Elisa、亲和力电泳等技术,研究人员也可以在筛选过程中实时检测到适配体与靶标的亲和力变化,以此优化筛选策略,筛选出亲和力较高的适配体。
答:核酸适配体的筛选通常从一个包含极高变异性的随机序列库开始,这使得每个适配体序列的亲和力和特异性差异较大。在SELEX(系统进化的配体酶联免疫法)等筛选技术中,库的多样性往往决定了筛选的有效性和成功率。为了应对这种多样性,筛选过程中会通过多轮选择逐步“富集”出与靶标结合最紧密的适配体。每一轮选择都会淘汰掉那些亲和力较低、无法有效结合靶标的序列,留下最强的结合者。随着筛选轮次的增加,适配体的亲和力和特异性会逐步提高。此外,可以通过优化筛选条件(如提高洗脱强度、改变温度和pH值)来加强适配体与靶标之间的相互作用。通过多轮的富集和精细化的筛选步骤,可以从高度多样化的库中筛选出特异性和亲和力都非常高的核酸适配体。
答:在核酸适配体筛选过程中,评估适配体的特异性是确保其在实际应用中有效性的关键步骤。通常,通过多种方法验证适配体与靶标的特异性。例如,可以通过亲和力层析、竞争性结合实验或ELISA等技术,检测适配体是否仅与目标分子结合,而不与非靶标分子发生交叉反应。在特异性评估中,竞争性结合实验尤为重要,通过与已知的抗原结合物竞争,确认核酸适配体是否选择性地结合到靶标而非其他类似分子。此外,利用高通量筛选技术(如微阵列、流式细胞术等)也可以在更大范围内检测适配体与多种靶标的反应,从而进一步确认适配体的选择性。对于具有高度特异性的适配体,它们通常仅能与特定的靶标结合,且结合常数(Kd)较小,而不与其他分子发生非特异性结合。因此,进行全面的特异性检测和验证是筛选过程中不可忽视的环节。
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