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核酸适配体筛选技术主要研究方向、进展与挑战

适体的介绍


单克隆抗体技术自1975年问世以来,已成为基础科学研究的重要工具,并广泛应用于药物开发、生物传感器等领域,具有深远的医学意义。世界上首个治疗性抗体于1986年被发现,并用于预防肾移植排斥反应。从那时起,许多抗体药物相继问世,成功用于治疗多种疾病,如哮喘。然而,单克隆抗体在疾病治疗中的应用仍然存在一定局限性。特别是对于脂质、碳水化合物和有机大分子的靶向治疗,抗体的亲和力通常较低,而且与药物偶联时的亲和力也容易受到影响。为此,人工配体-适体技术逐渐成为新的研究热点,作为传统单克隆抗体的有效补充,展现了更高的灵活性和广泛的应用前景。

适配体是一类由单链核酸构成的分子,可以特异性地与多种靶标结合。相比传统抗体,适配体具有体积小、合成成本低、结构均匀、易于定制修饰等独特优势。此外,作为核酸模板,它们的稳定性和可控性也使其在药物开发中具有显著的潜力。适配体的应用范围广泛,可以覆盖传统抗体难以识别的小分子、离子等靶标,成为一种有力的人工配体补充方案,逐渐在多个领域崭露头角。

核酸适配体是一类具有高度特异性分子识别能力的单链DNA或RNA分子,经过SELEX技术(系统进化的配体富集技术)在体外筛选得到。这些适配体由20至110个核苷酸组成,其序列包括随机区域和固定区域。通过自我折叠,适配体能够形成具有三级结构的小分子基团,具备高亲和力并能特异性地结合目标分子。

核酸适配体优点:①具有热稳定性高、便于化学合成与修饰、免疫原性低等优点,应用于生物分析、生物医学、生物技术、传感技术等领域。②具有生产时间短、成本低等、高度特异性优点,在骨科领域具有广阔的应用前景。

核酸适配体缺点:筛选费时费力、失败率高、成本高。

 

适体体外筛选的方法:SELEX


SELEX是一种适体体外筛选的方法,其原理如下:

(1)核酸配体库设计

核酸配体库可以通过化学合成或生物合成的方法制备。

(2)亲和筛选

将核酸配体库与靶分子混合孵育,通过固相吸附、磁珠法、过滤法、凝胶电泳法等方法将核酸/靶分子复合物与游离的核酸序列分离。

(3)洗脱

获得核酸/靶分子复合物,释放出结合靶分子的核酸序列。

(4)PCR扩增

通过PCR进行扩增,得到核酸库便于下一轮筛选。

(5)循环筛选

重复上述步骤进行多轮筛选,以提高结合靶分子的核酸序列占比。

适体筛选技术的示意图模型-泰克生物.jpeg

Fig.1 适体筛选技术的示意图模型


SELEX方法的研究进展


核酸适配体领域发展迅速,SELEX技术的靶标范围从最初的纯化蛋白质和有机小分子已经拓展到细胞、病毒、组织切片、离子等几乎所有类型的靶标。

Negative-SELEX、Counter-SELEX、Subtractive-SELEX是目前筛选技术中提高核酸适配体特异性的常规技术步骤。随着二代测序价格的大幅下降,High-throughput-SELEX的二代测序技术已经是目前核酸适配体筛选进程研究、候选适配体筛选的常规技术步骤。MB-SELEX和Cell-SELEX在蛋白质靶标和肿瘤细胞特异性的核酸适配体筛选中应用极为广泛。琼脂糖凝胶微球-SELEX和MB-SELEX常用于小分子靶标核酸适配体筛。

近年来Capture-SELEX和GO-SELEX的应用越来越广泛,特别是优化的Capture-SELEX。SOMAmer-SELEX需要使用化学修饰的文库;M-SELEX和Particle Display-SELEX需要非商业化的微流控装置;CE-SELEX需要复杂的分离条件优化和装置。这些局限性使这些方法相比上述其他方法的推广应用较少。近些年来,M-SELEX技术的发展趋势是面向集成化、微型化,但是筛选效率还有待提高。CE-SELEX在2004年首次报道以来,陆续报道了一系列改良的方法。

根据SELEX流程中分离结合序列与未结合序列的方法分类,可分为基于磁珠的SELEX、基于文库固定的SELEX、基于微流控技术的SELEX,或者基于毛细管电泳(CE)的SELEX等。


SELEX方法的挑战


适体在与细胞受体结合后内化,成为药物的靶向递送剂。但治疗效果受到固有的物理化学特性的影响,比如代谢不稳定、肾脏快速滤过、从血浆室快速分布到组织(如肝脏、脾脏)、非特异性免疫激活和多阴离子效应。


泰克生物公司已成功完成多个核酸适配体项目,积累了丰富的实践经验和成熟的技术体系,能够为客户提供高效的解决方案。凭借在核酸适配体领域的深入研究,公司不仅在项目实施上取得了显著成绩,还在技术开发和创新上保持领先地位。此外,泰克生物公司还提供一系列定制化服务,包括核酸适配体库的设计与构建、抗体的表达与纯化、亲和力测定、抗体序列分析及后续优化等。通过这些服务,公司能够为客户提供从初步设计到最终产品的全程支持,确保满足不同客户在科研和应用中的个性化需求。

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