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蛋白核酸适配体筛选服务
泰克生物致力于为客户提供高亲和力、高特异性的核酸适配体筛选技术服务,为客户后续的适配体功能验证(包括但不限于亲和力验证、竞争ELISA验证、体外靶向细胞功能性验证(例如:核酸适配体的体外识别和抑制功能验证、体外流式阻断功能等)、体内功能验证(例如:适配体的体内靶向抑制功能验证、信号通路阻断功能验证等))及靶向特定分子药物的开发等下游研发工作提供有力支持。泰克生物在核酸适配体筛选(SELEX技术)方面拥有多年的项目经验和心得,经过多年的发展,泰克生物建立了完善的核酸适配体筛选体系,能够为客户提供高质量的针对包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸、小分子化合物等靶点的核酸适配体(包括RNA适配体和DNA适配体)筛选服务。
█ 核酸适配体开发技术服务(SELEX筛选技术服务)
核酸适配体筛选是指基于指数富集的配体系统进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)原理,将筛选靶点结合在筛选固相颗粒的表面,通过与核酸适配体文库的孵育、清洗和扩增,从核酸适配体文库中得到的目的寡核苷酸片段(DNA片段或RNA片段)。
泰克生物建立的核酸适配体文库库容为10^14数量级,足够筛选到针对各类靶点且满足客户下游实验需求的核酸适配体,候选适配体序列亲和力可达nM-pM级别。 泰克生物能提供的抗原筛选(包括但不限于蛋白、多肽、氨基酸、小分子等)多种多样,适配体筛选的方法也多种多样(例如:磁珠-SELEX、细胞-SELEX、捕获-SELEX等),常用的筛选方法为磁珠筛选。对于特殊的样本,筛选方式会有所不同,比如药物小分子需要筛选适配体,常常需用到小分子改造技术。泰克生物的科学家会根据客户的项目需求进行评估,并设计最佳的方案进行抗原的修饰和适配体的筛选。核酸适配体筛选流程如图1所示:
图1核酸适配体筛选流程(SELEX方法的典型程序)
泰克生物还能提供包括但不限于核酸适配体的亲和力验证(包括BLI亲和力验证和SPR亲和力验证)、竞争ELISA验证、流式阻断验证等多种配套的下游验证实验,客户只需要提供筛选靶点和项目需求,泰克生物的科学家针对客户的项目需求提供合理的定制化的方案,解决客户的科研难题。
█ 服务内容和周期
步骤 | 服务内容 | 周期 |
Step1:核酸适配体筛选 | 1) 客户提供筛选靶点信息,泰克生物进行项目评估以及修饰工作(常规修饰:biotin修饰); 2) 文库富集与筛选:6-10轮筛选,SA磁珠负筛选;NGS测序; 3) 交付:适配体序列10-50条,包含出现频次;实验报告 | 8-12周 |
Step2:适配体合成和亲和力测定 | 1) 合成生物素标记适配体(根据具体情况设计与合成); 2) 适配体与靶点快速亲和力测定(亲和力排序); 3) 交付:合成报告,亲和力测定实验报告,原始数据 | 3-4周 |
█ 核酸适配体筛选服务优势
多种筛选靶点可选:蛋白、多肽、氨基酸、小分子等 | 文库库容大,项目成功率高 | SELEX技术平台成熟:筛选获得的核酸适 配体亲和力可达nM-pM级别 |
配套的下游验证实验丰富:亲和力验证(包 括BLI和SPR亲和力验证)、竞争ELISA验证 、流式阻断验证等 |
实验记录可追溯:中英文实验报告, 原始实验记录 | 一对一个性化方案定制,满足各类客户的科 研项目需求 | 6-10轮压力筛选,能够获得高亲和力、 高特异性的核酸适配体 | 多种筛选方式:磁珠-SELEX、细胞-SELEX、 捕获-SELEX等 |
答:在蛋白核酸适配体筛选服务中,核酸筛选的效率及其重要,筛选效率决定着我们能否得到高亲和力的适配体。但是在某些筛选实验中由于适配体文库设计不合理等原因影响,导致整个筛选服务过程中,我们的筛选周期过长,筛选的成本提高,并且我们最后得到的适配体可能亲和力不高,为了提高核酸适配体服务的筛选效率,泰克生物首先通过提高文库多样性,构建出序列更多的随机的寡核苷酸文库,这样实验中就可以增加筛选的效率,更有可能获得高亲和力适配体。接着泰克生物改进了适配体的筛选方法,技术人员采用HPCE等新技术,帮助完成高效率分离和筛选服务,这些新的技术手段和之前的技术相比,分离的速度更快、并且需要的人力减少。同时,泰克生物的技术人员也通过优化筛选条件,如靶标浓度、孵育时间、洗涤次数等,来减少筛选过程中轮数,缩短筛选的周期时间。我们也引进了新的筛选策略,比如双靶标筛选、竞争性筛选等,帮助提高筛选效率。
答:核酸与蛋白间的相互作用,构成了生命活动的基础。适配体,作为通过体外进化技术获得的独特单链寡核苷酸分子,具备与各种物质发生反应的能力。改变其结构能够改变它们和蛋白之间的作用,从而进一步波及相关的细胞功能。近年来,随着适配体与蛋白质相互作用研究的不断深入,基于这一相互作用的分析技术得到了发展。适配体是通过SELEX技术从核酸分子文库中体外选择的单链RNA或DNA分子,通过高亲和力特异性筛选出结合蛋白的适配体。该适配体因其可以重复使用、容易进行固定、工业化生产产品间差异小等原因,在传感器领域被研究人员使用。适配体能将造影剂送到MR成像的的需要位置,在递送放射性核素探针方面潜力巨大,被标记的适配体还用于成像分析,用于与退行性疾病事件的调节和研究。还有研究人员发现蛋白质通过转化为由结合 TfR 受体的适体的 ProSNA 来增强向大脑的传达。
答:在蛋白核酸适配体筛选服务中,适配体的特异性决定着产品能否正常交付,由于筛选的过程中会出现非特异性结合、或者靶标污染、筛选条件不严格等问题,会导致获得的适配体无法识别目的蛋白,进而去影响我们产品的后续应用。泰克生物通过反复多次的筛选和PCR扩增,将能够与目的蛋白结合的适配体序列富集起来。这一个过程中,泰克生物的研究人员一步一步增加了筛选的严格性,来提高适配体的特异性。除了上述办法,我们还可以进行负筛来提高特异性,通过在筛选过程中加入与目标蛋白结构相似但不发生结合的分子作为负筛靶标,这样负筛有利于帮助去除那些发生非特异性结合的序列,进而提高特异性。
答:在整个服务过程中,我们可能会遇到筛选出的适配体不稳定的情况,结构容易被周围的环境因素所影响,会导致它的应用效果不佳,甚至出现没有反应的情况。针对上述情况,泰克生物通过对适配体进行化学修饰,比如我们引入了能够抵抗核酸酶降解的化学基团,来帮助我们提高核酸适配体在机体内的稳定性。同时,为了提升其稳定性并降低因结构变动引发的失活风险,我们还对核酸适配体的二级乃至三级结构进行了相应的优化调整。同时我们也进行了一个缓冲液的优化,选择适合适配体结构的缓冲液体系,帮助适配体维持结构稳定。
答:蛋白核酸适配体技术能够高特异性、高亲和力地识别并结合目的靶标蛋白,这种蛋白-适配体的结合程度甚至和抗体与抗原的结合程度不相上下。核酸适配体可以通过现有的成熟的DNA合成技术、PCR扩增技术或RNA的体外转录技术等在体外完成快速、方便的合成,并且合成的成本相对较低,这种合成方便进行化学修饰,来满足科研人员在各个方面的不同应用。核酸适配体的分子量较小,具有良好的稳定性,在各种化学溶剂和高温下也能保持原来的结构,同时,因其分子量小可以减少副作用。除此之外,核酸适配体的靶标分子范围广泛,各种生物大分子,都可以是它的靶标分子。而且它的缺点是,可能被酶降解,也可能在通过肾脏时被清除,并且,筛选难度大,时间长。蛋白核酸适配体的主要应用于药物筛选、靶向位点的基因治疗以及某些疾病的基因诊断中。
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